逍遥来到蜀山，找到剑圣。本想求剑圣答应让他成为蜀山派剑仙的入室弟子，怎料他发现剑圣手上有一串玉佛珠……

　　这串玉佛珠一直挂在灵儿身上。逍遥追问之下，剑圣直言灵儿已被他锁入了镇妖塔。此时，逍遥和月如才知道灵儿是蛇妖而不是人。但逍遥无论如何都要救走灵儿。月如陪他一起闯入镇妖塔，由于生死未卜，逍遥答应月如，成功救出灵儿之后，他会跟月如相爱相随到老。

　　在酒剑仙的相助之下，月如和逍遥成功入了塔，找到灵儿。月如对灵儿说，出去之后，她们俩以后就是好姊妹，她愿与灵儿一起爱逍遥，二人同侍一夫。灵儿深觉自己只不过是只蛇妖，根本无法正常地跟逍遥相爱，有意成全逍遥和月如。月如反而鼓励她说：不论是人是妖，只要真心相爱，令对方快乐就好。三人想要离开镇妖塔，此时才知道，要离开便得先把塔毁掉。逍遥和月如潜入塔底的水中，杀败藏在塔底的七条金龙。

　　锁妖塔倒塌，危急关头，月如为救逍遥，掉进塔底的化骨池，剑圣在他们入塔前曾说，如果是魔是妖，掉进化骨池，必死无疑，是剩一副白骨，如果是人，则安然无恙，可是当月如掉进化骨池时，只见池中浮起一副白骨，逍遥欲跳下相救，惜为时已晚，此时塔已倒塌，逍遥忍受巨大的悲痛，带着灵儿逃出镇妖塔。

　　逍遥为月如的死去，伤痛悲哀，灵儿更是自责，逍遥指责剑圣害死月如，又说什么化骨池只化妖魔不化人，为何月如是人，也会遭受吞噬？﹗剑圣深感遗憾，后酒剑仙赶到，道出查证灵儿乃神灵之化身，女娲之后，剑圣后悔莫及，带领逍遥和灵儿去见圣姑，并把自己毕生的功力，转授给逍遥，以作补偿，然后便绝迹而去。圣姑为逍遥和灵儿治伤，并指出灵儿是妖不是人，因为被关在塔中有一段时间，故元气大损，要救灵儿，唯一的方法就是要找到凤凰蛋及火麒麟角。逍遥立刻动身前往寻找。

　　逍遥首先找到凤凰蛋，可是有一位叫阿奴的女孩子负责看守着这些蛋，不许他拿走。原来阿奴是拜月教人，善用毒，经过一番较量，阿奴十分喜欢逍遥，不但将凤凰蛋交给逍遥，还愿意协助逍遥前去大理城找火琪麟角。

　　阿奴带着逍遥走进大理城，千辛万苦终于找到火琪麟角，返回圣姑处救灵儿。不久，灵儿的女儿出世，灵儿提议为女儿取名忆如，以纪念月如。

　　时阿奴发现灵儿正是拜月教众正在寻找的神冥后人、巫神女继任人，并道出拜月国已分裂成白月族与黑月族，族人自相残杀，只有巫神女继任人的灵儿能够救众人出水深火热之中。

　　阿奴领着逍遥、灵儿一起走进拜月国。拜月国动乱在即，邪恶的黑月族蠢蠢欲动，想要进攻白月族。两族如果发生内斗，势必两败俱伤。

　　逍遥进城后，偷入圣坛，看见女娲像。拜月国的巫后神灵存于女娲像中，突然显灵，巫后用法力把逍遥带回十年前去，让他知道往事……

　　逍遥因此得知灵儿的身世，以及种种事情的前因后果……

　　逍遥回到十年前，无意中救了只有几岁大的灵儿和姥姥，并且救出巫后。二人查出拜月教教主利用「水灵兽」引起水灾，诬灭巫后。巫后并自毁身体，以打败水灵兽，但水灵兽太强，打不死。巫后施法令逍遥回到现实。

　　阿奴一直跪在神像前为逍遥祷告，终于看见逍遥重返，开心忘形之际，亦令逍遥感到她对他的情意。

　　逍遥把事件始末告诉灵儿，并将从巫后那儿得到的各种利害武器交给灵儿。灵儿知道自己族人有难，就算牺牲自己也要化解国家危机。

　　逍遥、灵儿和阿奴再度入城，此时，黑月族已对白月族进攻得如火如荼。灵儿来到王宫，白月族巫王〈灵儿生父〉已身负重伤。父女久别重逢，互诉心曲。怎料巫王突出手重击灵儿，灵儿不备，受了伤。原来这个巫王是假的，乃树妖所变。真正的巫王早已不在人世。灵儿与逍遥及阿奴狙击拜月教教主，教主跳入水中，同水灵兽合为一体，威力骤增。灵儿、逍遥和阿奴都不是对手，最后，灵儿竟自爆身体，歼灭了水灵兽。

　　事情过去，拜月国竟然下起前所未见的大雪来！逍遥相信灵儿仍在人世，不管天涯海角，他相信自己一定会找到灵儿，阿奴本想跟随，可是逍遥勒令阿奴离开他，因不想耽误她。雪地之中，逍遥踏上旅途，披一身雪白，身影渐远，与天地融为一体，阿奴用笛子吹奏一曲，送别逍遥，并借此传达爱意。